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La realtà naturale è un sistema ordinato di elementi,in cui tutte le cose trovano il loro spazio,il loro modo di esprimersi, con una precisione perfetta.Che la natura sia un sistema è confermato dalle dimostrazioni scientifiche, le quali evidenziano come lanatura sia un insieme ordinato di eventi, che si ripetono secondo delle leggi. Non è perciò ammissibile affermare che la natura è un insieme disordinato, poiché altrimenti non esisterebbero tesi scientifiche valide.
Si può pensare che la natura sia organizzata come una costruzione piramidale, dove ogni gradino è materia per lo sviluppo del grado superiore .Al vertice della piramide si troverebbe Dio, che governa tutti i fenomeni della natura come un’intelligenza ordinatrice della realtà. Se quindi si ipotizza che alla base di tutti i componenti della natura vi siano atomi, questi rappresenterebbero la causa materiale, ovvero la sostanza da cui tutto ha origine. Dio, al contrario, rappresenterebbe la causa efficiente, ovvero colui che trasforma ed elabora il materiale in vista di una sua organizzazione. E la causa finale? La cosa più logica sarebbe pensare che tutta la natura si ordinasse e si mantenesse in vista della vita.